深圳大学于1985年,经原国家教委教研司011号文件批准,深圳大学经济学(特区经济)和企业管理专业开始招收硕士研究生,至1988年共招收4届19名硕士研究生。1993年至1996年,该校经济学、中国古代文学、马克思主义哲学、建筑设计及其理论4个专业分别与华南师范大学、华南理工大学联合培养硕士生研究生共10人。2014年11月27日,在前期筹建的基础上,深圳大学正式发文,成立研究生院。