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上海市环境监测中心建于1983年，是从事环境监测的公益性科学技术事业单位，隶属上海市环境保护局，业务上受中国环境监测总站的指导，属全国环境监测一级站。

上海市环境保护局主要职责内设机构和人员编制规定根据《中共中央办公厅、国务院办公厅关于印发〈上海市人民政府机构改革方案〉的通知》（厅字〔2008〕17号）的规定，设立上海市环境保护局，为市政府组成部门。