厦门大学研究生教育始于1926年，是国内早招收研究生的大学之一。全国解放后，厦门大学为了适应我国社会主义建设和高等教育事业发展的需要，于1950年重新开始招收研究生，并于1952年成立研究（生）部。从1950年至1965年厦门大学在22个专业招收了研究生110名。1978年全国恢复招收研究生，1981年实行学位制度，厦门大学研究生教育迎来新的发展。1986年9月，经国务院批准，厦门大学试办研究
厦门大学经济学院是厦门大学规模大的学院。现有经济学系、计划统计系、财政系、金融系、国际经济与贸易系和经济研究所、宏观经济研究中心、中国能源经济研究中心等8个教学科研单位，并设有教学实验中心。
厦门大学嘉庚学院创办于2003年，是经国家教育部批准，由教育部直属重点大学厦门大学和厦门嘉庚教育发展有限公司共同举办的，按新机制和新模式运作的独立学院。2010年7月，学校获评“全国先进独立学院”。2011、2012年，学校获评“中国具品牌价值独立学院”榜首。2013年，学校荣登“回响中国”具领导力独立学院榜首。2014年，学校再次登上“回响中国”具知名度独立学院榜首。
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